Hükümdarlar Hıristiyanlığın yayılmasını tercih ve yurtdışı doktrin getirilen süreler utanç içinde kanıtladı ve onun takipçileri zulüm edildiğinde Japon tarihinin içinde bir dönemdi. XV ve XVI yüzyıllarda Hıristiyanlık adalar adalar hızla yayıldı, ancak XVI yüzyılın sonlarında yasaklandı ve Japon halkı gizlice uygulamıştır. Nagasaki sakinleri onlar Hıristiyan olmadıklarını kanıtlamak için her yıl kaldılar. Onlar İsa ve Tanrı'nın annesi, bu ritüelin imajını flout sunulan Bunu yapmak için, onlar XIX yüzyılın ortalarına kadar geçmek zorunda kaldı. Genel olarak, Hıristiyanlık bu dönemde olduğu kadar iki buçuk yüzyıllar olarak, tarafından Japonya'da yasaklandı, idam, işkence ya da din professing binlerce kişi sınır dışı edildi.

Nagasaki 5 Şubat 1597 alenen 20 Japon, dört İspanyollar yanı sıra Meksika ve Hint vardı aralarında 26 kişi, misyonerlik çalışmaları için idam edildi. Daha sonra hükümdarlık Shogun emriyle Toyotomi Hideyoshi Hıristiyanlar sonra Nagasaki koymak, işkence gördü ve bir tepenin üzerine inşa Nisidzaka çarmıhta çarmıha gerildi tutukladı. Kurbanların yürütme şehit olduktan sonra aziz okumak ve onlara farklı oyunlarını tanımak gibi. Bir tepe üzerinde 1962 yılında kanonizasyon sonra yüz yılda bir anıt ve müze açıldı. 6 Şubat Japonya'da Katolik Kilisesi kendi hafızasını kutluyor.

Müze Japonya, Japonya'da erken Hıristiyanlık döneminde sanat Avrupa'dan getirilen ve oluşan önemli tarihi belgeler içermektedir. Sergi kronolojik kez Hıristiyanların zulüm ve kendini tecrit durumunun döneminde gizli Katolik yaşam, erken Hıristiyanlık dönemi ziyaretçileri bilgilendirmek.

Şu anda, Hıristiyanlık Budizm ve Şinto sonra Japonya'da büyük dinlerin üçüncüsü. XXI yüzyılın başında, yaklaşık 2, 5 milyon Hıristiyan, çoğunlukla Katolik vardı.